O estado do Rio Grande do Sul é o maior produtor de uvas no país, tendo a Serra Gaúcha como a região que mais se destaca em área plantada, sendo assim a mesma também desponta como grande produtora de vinhos finos. Como os vinhos de altitude possuem grande concentração de ácido L-málico expressando uma acidez acentuada, realiza-se a fermentação malolática no intuito de melhorar a palatabilidade dos mesmos, agregando qualidade organoléptica e diminuindo a acidez. As responsáveis por esta fermentação são as bactérias ácido láticas, que estão presentes naturalmente nas uvas, porém uma fermentação de qualidade é realizada por cepas que descarboxilem o ácido L-Málico, produzindo ácido L-Lático e CO₂. O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética destas bactérias isoladas de uvas tintas: Merlot, Pinot Noir e Cabernet Sauvignon. Foi realizada a extração e quantificação do DNA genômico total e posterior amplificação PCR-RAPD dos isolados e de bactérias comerciais Oenococcus oeni e Lactobacillus plantarum, para avaliar a diversidade genética entre os mesmos. A amplificação dos fragmentos foi realizada com 4 primers não específicos, e corrida em gel de agarose 1,4%. Os géis foram fotografados, as bandas contadas, totalizando 38, com tamanho variando entre 0,5 a 2,0 kb, sendo possível evidenciar a diversidade genética entre os isolados analisados. De acordo com a presença ou ausência das bandas foi construída uma matriz binária com o software Excel e a plotagem destes dados em um dendrograma, através do software PAST, utilizando o método UPGMA e coeficiente de Jaccard. Os resultados demostram uma grande variabilidade genética, com a formação de grupos definidos, tendendo tanto para O. Oeni quanto para L. plantarum. O primeiro grupo apresentou um grau de similaridade de 60%, enquanto os demais isolados apresentam em torno de 40% de semelhança. Estes valores podem ser explicados pela atividade ou não das enzimas málica e malato desidrogenase, presente nas cepas estudadas, sendo responsáveis pela descarboxilação do ácido L-Málico, porém apenas a enzima málica realiza a produção de gás carbônico, o que é de interesse para a produção de vinhos. A técnica empregada permitiu diferenciar as bactérias ácido láticas isoladas, bem como agrupá-las de acordo com a semelhança em relação as cepas comerciais, porém não houve ligação dos agrupamentos formados de acordo com as variedades de uva utilizadas. O estudo permitiu inferir quais são mais aptas para a realização da Fermentação Malolática na indústria enológica, de acordo com sua semelhanca a O. oeni.