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Análise Computacional do Efeito dos Polimorfismos Não Sinônimos no Gene SLC6A4 Humano Associado ao Transtorno de Ansiedade Generalizado
Bryan Josue Solis, Juliana Schmitt de Nonohay, Diego Hepp

Última alteração: 16-10-2019

Resumo


O transtorno de ansiedade generalizada (TAG) é definido como ansiedade e preocupação excessivas, por seis meses ou mais, acompanhadas por sintomas somáticos, cognitivos, comportamentais e perceptivos. No Brasil, se estima que a prevalência dos transtornos de ansiedade variam 10%-18%. TAG afeta 4%-7% da população em algum ponto da sua vida, enquanto 3%-5% da população está atualmente diagnosticada. Estudos apontam que a proteína  5-HTT (serotonin transporter polymorphic region) possui um papel crucial em  indivíduos que apresentam traços comportamentais relacionados ao TAG. Ela é responsável por bombear o excedente de  serotonina nas sinapses, de modo a reduzir a estimulação neuronal. Se esse transportador falha, o excesso de excitação elétrica nos neurônios serotonérgicos pode levá-los ao colapso. Os polimorfismos presentes no gene que codifica 5-HTT são relacionados à falha desse transportador, podendo ocasionar mudanças que afetam o modo que as pessoas lidam com situações estressantes. Através da predição computacional, visa-se avaliar o efeito dos polimorfismos conhecidos como nsSNPs, variações genéticas de uma única base de DNA não sinônimas presentes no gene SLC6A4 que codifica 5-HTT. Para isso, utilizam-se ferramentas computacionais que permitem a avaliação do grau de conservação evolutiva dos aminoácidos afetados na proteína, classificando aqueles com maior conservação como potencialmente danosos. A análise do efeito dos nsSNPs no gene SLC6A4 humano foi realizado através das ferramentas de predição MutationAssessor, PANTHER, Polyphen-2, PROVEAN e SNPs&GO. Os polimorfismos do gene de interesse foram identificados através de dbSNP do NCBI (National Center for Biotechnological Information) e foram coletados ID dos nsSNPs, posição no cromossomo, códon alterado e alelos. Os resultados das Ferramentas Mutation Assessor, PANTHER, Polyphen-2, PROVEAN e SNPs&GO identificaram, respectivamente, como danosos 166, 288, 172, 170 e 108 nsSNPs. Os resultados da análise dos 343 nsSNPs presentes no gene SLC6A4 foram classificados segundo a concordância de predição de cada nsSNP feita pelas ferramentas. Se observou que 94 mutações foram classificadas como danosas pelas 5 ferramentas, enquanto 46 foram classificadas como não danosas por todas as ferramentas. Na literatura podem se encontrar autores que associaram o nsSNP I425V (rs28914832) com transtorno obsessivo-compulsivo (TOC) e com a variação na atividade de transporte de serotonina. No entanto, o número de publicações que relatam uma relação entre TAG e nsSNPs são baixas, evidenciando que esse tipo de estudos genéticos não são um alvo de interesse. Portanto, a análise e classificação dos nsSNPs no gene SLC6A4 pelas diferentes ferramentas utilizadas permitirá a priorização das variações danosas para estudos posteriores, visando o entendimento do seu papel no transtorno de ansiedade generalizada.


Palavras-chave


Transtorno de Ansiedade; Bioinformática; Polimorfismos não sinônimos

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