O estado do Rio Grande do Sul é na atualidade um dos maiores produtores de arroz orgânico da América Latina, conforme dados do Instituto Rio-grandense do Arroz (IRGA). Cerca de 30% dessa produção provém da Associação de Moradores do Assentamento Filhos de Sepé (AAFISE) - Viamão/RS. As lavouras da AAFISE, onde ocorre essa produção, estão situadas dentro da Área de Proteção Ambiental (APA) do Banhado Grande. A irrigação do arroz é provida por comportas de uma barragem abastecida por águas oriundas de charco. As águas drenadas, do arroz orgânico cultivado no assentamento, vêm apresentando altos teores de turbidez, o que está em desacordo com o limite máximo estabelecido pela Resolução CONAMA 375/05. Em virtude de uma demanda do assentamento por um diagnóstico adequado sobre os possíveis fatores que estão relacionados com estes teores de turbidez, o objetivo desde trabalho foi analisar amostras de águas de irrigação e de águas de drenagem das lavouras, visando realizar um diagnóstico inicial. Foi realizada a escolha de pontos amostrais para coleta de água na entrada da água (irrigação) para cada lavoura do estudo, e na saída (drenagem) no final do processo produtivo. As coletas foram feitas em frascos de polietileno previamente higienizados. Após as coletas, as amostras foram acondicionadas e resfriadas em caixa de isopor e imediatamente encaminhadas ao laboratório especializado para as análises físico-químicas de interesse. Os resultados indicaram maiores alterações, no que concerne o parâmetro de turbidez em específico, após o contato com os diferentes tipos de solos, devido ao aumento de sólidos em suspensão. Outros parâmetros também apresentaram alterações, como fósforo total e potássio, que no momento em que a água é drenada das canchas, são carregados pela água. A indicação da oscilação do oxigênio dissolvido nas amostras pode ter relação com os tipos de solo. Ao final do processo produtivo, no canal de drenagem total da água das lavouras, a amostra coletada apresentou um valor de turbidez menor do que a amostra coletada na entrada da água da barragem para a irrigação das lavouras. Neste ponto de coleta, os valores dos nutrientes, como fósforo e potássio, apresentaram alterações em todas as amostras analisadas.  Estas alterações podem estar relacionadas com a ineficiência na adubação e a não fixação dos nutrientes no solo. Alterações nestes parâmetros também podem contribuir para a proliferação da flora aquática.